הוועד המנהל אחראי על מדיניות האקדמיה הצעירה ומקביל בתפקידו למועצת האקדמיה הלאומית הישראלית למדעים.
חברי הוועד המנהל של האקדמיה הצעירה הישראלית לשנת 2027-2026:
הוועד המנהל של האקדמיה הצעירה הישראלית לשנת 2027-2026. מימין לשמאל: פרופ' אורי בן-דוד, פרופ' יצחק ברקוביץ וד"ר עדי אשכנזי